Rubriky | Svět

Vědci poprvé vytvořili počítačovou simulaci celého organismu

Zveřejněno 10 května 2013 autorem FreePub

Seznamte se všichni s Mycoplasma genitalium, subjektem mnoha vědeckých prací a nyní organismem, který byl kompletně vytvořen binárně.

Červenec 2012.

Počítačové modely jsou často použity pro zjednodušení, nebo když studujete skutečné věci, které nejsou vidět, ale většinou jako izolovaný proces.

Výzkumníci ze Stanfordu chtěli prolomit tradici a vybrali jeden z nejjednodušších organismů v okolí – Mycoplasma genitalium jako jejich testovací subjekt.

Porovnali data z více jak 900 publikací, aby zjistili, co všechno se děje v buňce bakterie. Ale nešlo jen o případ spuštěného modelu každého buněčného procesu. Museli počítat se všemi interakcemi – což je v podstatě matematické peklo.

Tým zvládl vytvořit buněčné dělení pomocí modelu, jehož jediné dělení trvalo skoro 10 hodin běžícího softwaru MATLAB na 128-jádrovém linuxovém clusteru. Reprezentace byla tak přesná, že dokázala předpovědět, jak bude Mycoplasma genitalium vypadat a to jen na základě genetických dat.

Model navíc objevil předtím neznámé nekonzistence v jednotlivých buněčných cyklech.

Takové simulace by mohly být v budoucnu použity k lepšímu pochopení komplikovaných biologických nemocí, jako je Alzheimer.

Zde je navíc video stanfordského výzkumníka Markuse Coverta:

Další zdroje:
In First, Software Emulates Lifespan of Entire Organism
Breakthrough: The First Complete Computer Model of a Living Organism
A Whole-Cell Computational Model Predicts Phenotype from Genotype

Překlad článku Scientists create first computer simulation of a complete organism
engadget.com/2012/07/24/first-simulated-organism/

  • Vložit komentář

    Time limit is exhausted. Please reload CAPTCHA.